��率甘军报卫京师。次年，又率军镇压河湟地区爆发的回族和撒拉族人民的反清斗争，因功晋升太子少保，调任甘肃提督，节制陕甘军马。

  而在戊戌政变之时，董福祥奉命率甘军进京。戊戌政变后，甘军被编入武卫军，成为北洋三军之一，董福祥任武卫军后军统领，驻防直隶、山西。

  随着帝国主义的不断入侵，京津一带爆发了规模浩大的义和团运动。

  董福祥所部奉命入京，驻扎永安门。日本使馆书记生曾山三彬明日张胆，乘车出迎八国联军，营官抽刀将其刺死。

  对于义和团，董福祥采取的完全是和武卫军前军统领聂士成不同的态度，他出身于草莽，对绿林道上的一套十分熟悉，知道义和团能够闹出这么大的声势来，背后一定有人支持，所以他对于义和团则是拉拢利用，但是却根本不信义和团那一套的东西。

  实际上他对于义和团那套骗人的东西早就摸清了，但是就当时那个满清朝廷的状况，本来就对洋人没有好感的他，自然选择了随大流，支持义和团了。

  只是这个朝廷或者应该说是西太后，她却一直在摇摆不定，让人弄不清楚她究竟是要和洋人开战呢？还是和洋人联手镇压义和团。

  即便是后来载漪炮制了一份西方列强勒令老太后归政的假照会，让西太后是恼怒不已，说是和洋人们开战了。

  可是在董福祥收到荣禄的命令去攻打那个洋人的使馆之时，却让他只是佯攻，不许真的打，不然只有数百人防守的公使馆，怎么可能挡的住有着数万人的武卫军进攻呢？就算那些使馆的护卫们个个是精锐，都能以一当百，围也把他们围死了。

  只是这个情况，让董福祥很是不满，在他看来既然和洋人们开仗了，就应该好好地打，让那些洋人们知道他们的厉害。

  可是真正和洋人们打起仗来，董福祥算是知道了那些洋人们枪炮的厉害了。

  董福祥的甘军虽然改编城了武卫后军，可是在武器装备上根本不能和武卫前军、右军比，他的武卫后军虽然有了一些快枪，也不过是千余支，还多是有枪无弹，多数人依然使用的是大刀、弓箭，而列强们则使用的都是后膛枪，后膛炮等先进武器。

  就像是东便门一战，虽然董福祥的士兵们发现了偷袭的俄军士兵，开枪击退了俄军的先头部队，可是在俄军调动了炮兵准备轰击城墙的时候，这些士兵们手中的武器根本不能破坏大炮，只能打死了拉炮的马匹迟滞俄军的进攻。

  而到达了天亮之时，俄军的主力部队赶了过来，炮兵对武卫后军防守的城墙展开了炮击，使得武卫军士兵不得不放弃了外城城墙的防守，退守到内城。

  董福祥在吃了没有火炮的亏之后，就在城内搜集了一些火炮拉到了齐化门那里，和日本人对攻了起来。

  在法军和意军的火炮支援下，日军还是成功地压制了城内的防御火力，并轻松俘虏了城外的数百名八旗兵。在炮群的连续轰击下，城墙上出现了大量的伤亡，没有预备队的董福祥部，战斗力逐渐低了下来，但是守城士兵士气并不低落，与日军僵持着，一直到天黑。傍晚时分，日军组织了敢死队，抬着巨大的炸药桶，一波接着一波前赴后继地向城墙接近，当天傍晚，日军工兵成功炸开了齐化门。

  董福祥所部不得不从齐化门撤离在内城筑起街垒，和八国联军进行巷战。

  而其他各部清军，例如马玉昆、宋庆等部几乎是不战而逃，天津保卫战聂士诚孤军作战的悲剧再度在董福祥身上重演，时人称北京之战时，清军“最为奋勇者，唯董福祥�