，可以自行组织行政机构、官员、军队、关税制度，但所有费用都由总督府自行承担，而且每年都需要向国内上交一笔税收费用。

  而三个总督区分别为：婆夷州区，包括加里曼丹岛、苏拉威西岛、马鲁古群岛，总督府设在苏卡达纳；爪哇区，包括爪哇岛、爪哇群岛、东帝汶群岛，总督府设在巴达维亚；金州区，包括苏门达腊岛，马来半岛等地区，总督府设在马六甲。这样一来，也就确立了中国在南洋地区的实际控制权。同时商毅也下令，将南洋舰队一分为二，分驻广州和马尼拉，以维持中国在南洋地区的军事力量。

  另外也规定,每一个总督区在年满五年之后，可以向国内申请建省，正式并入国内。

  随后内阁又连续发布了三个法案：［南洋移民法案］、［南洋土地开发法案］、［海外岛屿认领法案］。

  ［南洋移民法案］规定：愿意移民吕宋以及南洋其他地区的百姓，以户为单位，按每户移民的人口数量，成人可以分配一百五十亩土地，并得到一百五十银元的补足，而未成年人也可分到五十亩土地，五十银元的补足，免费发给农耕用具和耕牛，并且免除三年的田税，但移民之后，在国内的户籍将取消，而且所分得的土地不许买卖，耕作三年之后，按国内的标准收取田税，五年之后土地归该户所有，可以由各户自行分配，买卖。

  ［南洋土地开发法案］规定：只要是中国的居民，就可以自行认领，所有中国所属的南洋地区空置土地，进行开发耕种，认领数量不限，但在认领之后，就要按照土地的数量，向中国政府交纳税收，在领认之后，土地也不得转让、买卖。政府将对认领土地实行保护，并可以使用在南洋战争中抓获的俘虏，做为开荒耕种的劳动力。在开发六年，并交纳了六年的税收之后，土地的所有权归认领人所有，可以自行分配，买卖。

  ［海外岛屿认领法案］则规定：除了中国政府规定，在南洋地区己经建立了中国势力的岛屿、地区之外，其他的无主空置岛屿，以及南洋以外的地区，都可以任由自行认领开发，并可在内阁的外交部申请注策，由中国政府承认为该土地的拥有权，并按注策土地面积向中国政府交税，在交缴了三年税赋之后，中国政府将给予提供保护。

  这三个法案中的前二个法案，都是甴国家组织，加大对南洋地区的移民进程，第一个法案主要是针对一般的平民，尽管现在中国大陆正在进行土地清查和重新分配，但每一户能够分配到的土地并算不多，以一个夫妻两人和两个小孩的四口之家的家庭为例，由于各地区的经济发展不同，因此在一般的情况下，可以分配到的土地在一百亩到一百五十亩之间，最多也不可能超过二百亩。而一但移民南洋，就可以获得四百亩的土地，这就差不多够得上一个小地主的标准了，而且还能得到四百元银元的补贴资金。因此移民南洋，对百姓来说还是有非常大的吸引力的。

  甴其是在东南沿海地区，因为经济发达，受内战的影响较小，可供分配的土地并不多，即使是土地重新分配，一般的百姓能够分配到的土地数量有限，而这一地区的百姓对南洋地区也有一定的了解，因此还是有相当一部份的百姓对移民到南洋还是有兴趣的。

  第二个法案则是针对那些有实力、有经济，敢于投资的富人，以及在南洋进行海外贸易的商人。他们可以从国家免费获得到南洋土地的使用权力，而国家则可以利用他们的资金和实力，以农庄、农场的形式，对南洋地区进行大规模的开发，以俘虏和当地土著为开发的劳动力，并收取税收，増加国府收入，并且作为国家主导海外移民的补充。两种形式双管齐下，来鼓励中国人对南洋地区的移民，加强南洋各国对中国的依附，以及中国对南洋地区的控制。

  而第三个法案则是